《最后一枪》以在国民政府实行“攘外必先安内”政策的背景下，中统下令抓捕一名在洪城隐藏极深、身手厉害的中共潜伏特工“独狼”的精彩故事展开，双方斗智斗勇，步步紧逼，最终由刘钧饰演的代号“独狼”的陈家二公子陈惠为保全弟弟不慎暴露身份遇害，其三弟陈泽(由保剑锋饰演)继承了二哥未完成的革命信仰，自此踏上了与身为中统高层忠于国民政府的大哥陈恩以及出卖哥哥的叛徒斗争的道路。全剧以悬疑元素贯穿，一个个隐藏极深的伪装，一重重精心布局的阴谋，都将被主人翁那最后一枪所瓦解。

十年内战期间，中共北平地下党员巩渭平受命在察哈尔抗日同盟军残部的独立营中发展党组织。由于叛徒的出卖，巩渭平确定的25名发展对象被捕并命悬一线。巩渭平只身“自首”试图换回为拯救25官兵的性命，然而却

故事发生在二十世纪四十年代初，日寇投降前夕的上海，日本驻上海的特务机关梅机关头目松田祯昭曾密藏了一份叫作蓝色档案的长期潜伏特务名单。为了获取这份名单，国民党中统局派遣了中统